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Text File  |  1995-03-04  |  3.1 KB  |  60 lines
  1. ****************************************************
  2. * Glucagon / GIP / secretin / VIP family signature *
  3. ****************************************************
  4.  
  5. A number of polypeptidic hormones,  mainly  expressed  in the intestine or the
  6. pancreas, belong to a group of structurally related peptides [1,2]. Members of
  7. this family are:
  8.  
  9.  - Glucagon, which promotes hydrolysis of glycogen  and lipids, and raises the
  10.    blood sugar level.
  11.  - Glucagon-like peptide 1 (GLP-1), a  peptide of  unknown  function processed
  12.    from the same precursor protein as that of glucagon.
  13.  - Glucagon-like  peptide  2  (GLP-2),   a  peptide of  unknown  function also
  14.    processed from  the  glucagon  precursor  protein but which, in contrast to
  15.    GLP-1, is only found in mammals.
  16.  - Gastric inhibitory  polypeptide (GIP),  which  is a  potent  stimulator  of
  17.    insulin  secretion  and   a   relatively  poor  inhibitor  of  gastric acid
  18.    secretion.
  19.  - Secretin, which stimulates formation of NaHCO(3)-rich pancreatic juice  and
  20.    secretion of NaHCO(3)-rich bile as well as inhibiting HCl production by the
  21.    stomach.
  22.  - Vasoactive  intestinal  peptide (VIP), which  causes vasodilatation, lowers
  23.    arterial blood  pressure,  stimulates  myocardial contractility,  increases
  24.    glycogenolysis and relaxes some smooth muscles.
  25.  - Peptide PHI-27, a vasodilator peptide which is coded by the  same precursor
  26.    protein as that of VIP.
  27.  - Growth  hormone-releasing factor (GRF) (also known as somatoliberin), which
  28.    is released by the hypothalamus and acts on the adenohypophyse to stimulate
  29.    the secretion of growth hormone.
  30.  - Pituitary adenylate cyclase activating polypeptide (PACAP) [3].
  31.  - Helospectin (exendin-1),  helodermin (exendin-2),  exendin-3, and exendin-4
  32.    from the venom of gila monsters.  The  exendins  are  peptides  with a VIP/
  33.    secretin biological activity [4].
  34.  - A peptide produced by the X-cells of the islets of ratfish pancreas [5].
  35.  
  36. As a pattern for this  family of peptides  (which are from 30 to 45 amino acid
  37. residues long), we used the  more or less conserved first ten positions of the
  38. N-terminal as well as a conserved hydrophobic residue in position 23.
  39.  
  40. -Consensus pattern: [YH]-[STAVGD]-[DEQ]-[AGF]-[LIVSTE]-[FYLR]-x-[DENSTA](2)-
  41.                     [LIVMFYG]-x(12)-[LIV]
  42. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  43. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Crithidia        fasciculata    DNA
  44.  topoisomerase II.
  45. -Last update: October 1993 / Pattern and text revised.
  46.  
  47. [ 1] Mutt V.
  48.      Ann. N.Y. Acad. Sci. 527:1-19(1988).
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  51.      Pecker F.
  52.      Ann. N.Y. Acad. Sci. 527:169-185(1988).
  53. [ 3] Miyata A., Arimura A., Dahl R.R., Minamino N., Uehara A., Jiang A.,
  54.      Culler M.D., Coy D.H.
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  60.