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Text File  |  1995-03-04  |  3.1 KB  |  60 lines

  1. ****************************************************
  2. * Glucagon / GIP / secretin / VIP family signature *
  3. ****************************************************
  4.  
  5. A number of polypeptidic hormones,  mainly  expressed  in the intestine or the
  6. pancreas, belong to a group of structurally related peptides [1,2]. Members of
  7. this family are:
  8.  
  9.  - Glucagon, which promotes hydrolysis of glycogen  and lipids, and raises the
  10.    blood sugar level.
  11.  - Glucagon-like peptide 1 (GLP-1), a  peptide of  unknown  function processed
  12.    from the same precursor protein as that of glucagon.
  13.  - Glucagon-like  peptide  2  (GLP-2),   a  peptide of  unknown  function also
  14.    processed from  the  glucagon  precursor  protein but which, in contrast to
  15.    GLP-1, is only found in mammals.
  16.  - Gastric inhibitory  polypeptide (GIP),  which  is a  potent  stimulator  of
  17.    insulin  secretion  and   a   relatively  poor  inhibitor  of  gastric acid
  18.    secretion.
  19.  - Secretin, which stimulates formation of NaHCO(3)-rich pancreatic juice  and
  20.    secretion of NaHCO(3)-rich bile as well as inhibiting HCl production by the
  21.    stomach.
  22.  - Vasoactive  intestinal  peptide (VIP), which  causes vasodilatation, lowers
  23.    arterial blood  pressure,  stimulates  myocardial contractility,  increases
  24.    glycogenolysis and relaxes some smooth muscles.
  25.  - Peptide PHI-27, a vasodilator peptide which is coded by the  same precursor
  26.    protein as that of VIP.
  27.  - Growth  hormone-releasing factor (GRF) (also known as somatoliberin), which
  28.    is released by the hypothalamus and acts on the adenohypophyse to stimulate
  29.    the secretion of growth hormone.
  30.  - Pituitary adenylate cyclase activating polypeptide (PACAP) [3].
  31.  - Helospectin (exendin-1),  helodermin (exendin-2),  exendin-3, and exendin-4
  32.    from the venom of gila monsters.  The  exendins  are  peptides  with a VIP/
  33.    secretin biological activity [4].
  34.  - A peptide produced by the X-cells of the islets of ratfish pancreas [5].
  35.  
  36. As a pattern for this  family of peptides  (which are from 30 to 45 amino acid
  37. residues long), we used the  more or less conserved first ten positions of the
  38. N-terminal as well as a conserved hydrophobic residue in position 23.
  39.  
  40. -Consensus pattern: [YH]-[STAVGD]-[DEQ]-[AGF]-[LIVSTE]-[FYLR]-x-[DENSTA](2)-
  41.                     [LIVMFYG]-x(12)-[LIV]
  42. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  43. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Crithidia        fasciculata    DNA
  44.  topoisomerase II.
  45. -Last update: October 1993 / Pattern and text revised.
  46.  
  47. [ 1] Mutt V.
  48.      Ann. N.Y. Acad. Sci. 527:1-19(1988).
  49. [ 2] Bataille D., Blache P., Mercier F., Jarrousse C., Kervran A., Dufour M.,
  50.      Mangeat P., Dubrasquet M., Mallat A., Lotersztajn S., Pavoine C.,
  51.      Pecker F.
  52.      Ann. N.Y. Acad. Sci. 527:169-185(1988).
  53. [ 3] Miyata A., Arimura A., Dahl R.R., Minamino N., Uehara A., Jiang A.,
  54.      Culler M.D., Coy D.H.
  55.      Biochem. Biophys. Res. Commun. 164:567-574(1989).
  56. [ 4] Eng J., Kleinman W.A., Singh L., Singh G., Raufman J.-P.
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  58. [ 5] Conlon J.M., Dafgard E., Falkmer S., Thim L.
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  60.